近日,公司美加墨世界杯动物医学免疫学研究团队在国际权威期刊《Nucleic Acids Research》(《核酸研究》)在线发表题为“Recognition of the wobble pair: quantum mechanical calculations of tRNA U34 or C34 modifications within the ribosomal decoding center”(遗传密码摆动碱基对的识别:核糖体解码中心内tRNA U34或C34修饰的量子力学计算)的研究论文,系统揭示了蛋白质翻译过程中一个关键但精妙的“摆动”机制。该研究利用量子力学计算,阐明了tRNA通过修饰进而“摆动识别”遗传密码的底层原理,为理解基因中遗传密码解码为蛋白质的翻译控制提供了新视角,为后续研究tRNA修饰异常与疾病(如神经系统疾病、代谢病等)提供了结构生物学的新认知。
基因组中的遗传信息(即遗传密码)通过转录传递给信使RNA,将特定的遗传密码的组合转换为蛋白质中的氨基酸序列,但这一蛋白翻译过程存在“不匹配”的可能,即RNA的密码子有61种,而细胞中携带氨基酸的“转运工具”tRNA却少于61种。科学家曾提出了著名的“摆动假说”,tRNA上反密码子的第34位碱基享有特殊的“自由”,它能与密码子第三位上的多个碱基发生非经典的配对,从而实现“一把钥匙开几把锁”。本研究首次从微观物理层面,揭开了第34位碱基上化学修饰如何赋予这种自由的“摆动”,即一定程度摆动解码,但不发生错误解码。研究团队通过量子力学计算,发现这些修饰不仅能锁定配对结构、诱导额外氢键,核糖体解码区的信使RNA也会通过微小构象调整提供柔性支持,创新提出“协同与动态互补”模型,揭示tRNA第34位的化学修饰、碱基本身的电子云状态,以及核糖体解码中心的微环境三者协同作用,从而实现“摆动配对”的识别机制。

公司美加墨世界杯预防兽医学硕士研究生刘一为论文第一作者,欧旭敏讲师、法国科学院Eric Westhof院士及贵州大学程安春教授为共同通讯作者。研究得到四川省科技厅项目及四川省兽药创新团队等资助。
原文链接:
https://academic.oup.com/nar/article/54/8/gkag299/8661662